到1997年，搜索引擎意识到网站管理员在促使他们的网站在搜索引擎中获得更好的排名，甚至有些网站管理员大量地在他们的页面中插入关键词（今天的杭州网站优化中被称为堆砌关键词的手段，属于黑帽优化的一种）。早期的搜索引擎，如Altavista或者infoseek，为了防止网站管理员 操控他们的排名二队搜索算法进行了调整。

由于高的营销价值有针对性的搜索结果，是有潜力的搜索引擎和搜索引擎优化服务提供商之间的矛盾关系。在2005年的年度会议AIRWeb对抗性信息检索在网络上，创建的讨论和积极的网络内容提供商的破坏性影响降到最低。

公司采用过于激进的技术可以得到他们的客户网站从搜索结果中禁止。 2005年，据华尔街日报报道，交通电力公司，据称用于高风险的技术并没有透露这些风险向它的客户。连线“杂志报道，同一家公司起诉的博客和搜索引擎优化Aaron Wall编写有关的禁令。谷歌的Matt Cutts后来证实，谷歌在事实上禁止交通电力和它的一些客户。

有些搜索引擎也达到了SEO行业，并经常在搜索引擎优化会议，聊天和研讨会的赞助商和嘉宾。主要搜索引擎提供信息和指导，以帮助网站优化谷歌有一个Sitemaps计划，以帮助站长学习，如果谷歌索引他们的网站上有任何问题，还提供了对谷歌流量的网站。兵工具箱提供了一种从网站管理员提交一个网站地图和网络订阅源，使用户能够确定的抓取速度，有多少他们的搜索引擎已经索引页。